Podstawowym zabiegiem, jaki oferują serwisy klimatyzacji auta, jest odgrzybianie całego układu. Najprostszym sposobem na pozbycie się grzybów, pleśni i innych drobnoustrojów chorobotwórczych jest ozonowanie. Trwa ono około trzydziestu minut i nie jest drogie. Zabieg ten polega na uruchomieniu we wnętrzu samochodu generatora ozonu i włączeniu wewnętrznego obiegu powietrza. Ozon wytwarzany przez generator dostaje się do kratek wentylacyjnych i usuwa z nich zanieczyszczenia.
Niektóre serwisy klimatyzacji oferują swym klientom oczyszczanie układu za pomocą specjalistycznych preparatów chemicznych. Chemia do układów klimatyzacji jest bezpiecznym i skutecznym sposobem na zdezynfekowanie całego układu. Zdaniem niektórych specjalistów najlepsze efekty uzyskuje się, korzystając z obu wymienionych metod jednocześnie.
Firmy serwisujące klimatyzację samochodową zalecają również regularne oczyszczanie skraplacza. Czynność tę najlepiej przeprowadzać po zimie. Czyszczenie skraplacza kosztuje niewiele, a skutecznie zabezpiecza ten element przed korozją, znacząco wydłużając jego żywotność. Wielu właścicieli aut wyposażonych w klimatyzację zapomina o wymianie osuszacza, który oferuje m.in. Clima Partner.
Według zaleceń producentów osuszacz powinno się wymieniać raz na dwa lub trzy lata. Zaniedbanie tej czynności może doprowadzić do wystąpienia poważniejszych usterek. Podczas serwisowania klimatyzacji należy także zwrócić uwagę na sprężarkę, stanowiącą serce całego układu. Serwis sprężarki polega na jej oczyszczeniu, wypłukaniu i wymianie zużytych łożysk.